L'organisation du Centre Universitaire de Missiologie est synthetisée par cet organigramme:
Le Centre a trois grandes missions : La formation, la recherche et le partenariat. C'est sur base de sa mission que se définit son organisation. Dans sa constitution, conformément aux articles 4 jusqu'à 38 il est prévu :
- un Conseil d'Administration,
- un Conseil de l'Université,
- un Comité de Gestion,
- un Conseil de Faculté
- un Conseil de Département
LE CONSEIL D'ADMINISTRATION
Le CA représenté le CUM en justice et dans tous les actes de la vie civile. Le CA a les pouvoirs les plus étendus pour la gestion des affaires de l'Université. Il établit notamment :
- le règlement d'ordre intérieur du centre,
- fixe les conditions d'admission de candidat ;
- détermine le régime des études théoriques, des stages, ainsi que les modalités d'examens ;
- Il formule les critères d'engagement et des promotions du personnel attaché du centre ;
- Il fixe aussi les attributions et le traitement conformément aux dispositions en vigueur en République Démocratique du Congo.
- Décide les nominations et les promotions du personnel académique, scientifique et administratif tel que définit par le statut du personnel du Centre
- Décide les révocations, les sanctions disciplinaires pour la bonne marche du Centre.
- Toute décision de principe importante est soumise à l'approbation du CA.
LE CONSEIL DE L'UNIVERSITE
Le conseil du centre est composé :
- du Doyen
- du Secrétaire Académique
- du secrétaire à la coopération & au partenariat
- du secrétaire chargé de la recherche
- de l'Administrateur
- chefs des Départements
- du bibliothécaire en chef
- d'un représentant du corps académique
- d'un représentant du corps scientifique
- d'un représentant du personnel administratif
- d'un représentant des étudiants
Le Conseil de l'Université a pour mission:
- Exécute la politique académique et scientifique du centre Universitaire de Missiologie
- Fait des propositions sur le Développement des activités académique et scientifique du Centre à soumettre au CA.
- Propose au CA, après avis des conseils du département le nombre d'heure de cours que compte l'enseignement de chaque matière ainsi que la répartition des matières par année d'Etudes.
- Délibère sur l'action de diplôme honorifique.
- Donne des avis sur les prévisions budgétaires de chaque département et activité du Centre ;
- Nomme et révoque le personnel académique et scientifique à temps partiel ;
- Propose au Conseil d'Administration, les nominations et les promotions du personnel académique, tel que définit par le statut du personnel du Centre
Propose au conseil d'Administration toutes sanctions disciplinaires contre le personnel académique et scientifique. Toute fois la présence des étudiants n'est pas requise au moment où la délibération se doit de statuer sur la carrière du personnel du Centre Univesitaire de Missiologie.
Le conseil de l'Université établit son règlement d'ordre intérieur qu'il soumet à l'approbation du Conseil d'Administration. Il se réunit au moins une fois le trimestre, ou chaque fois que les besoins l'exigent.